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  • Le logiciel de comptabilité adapté à une entreprise individuelle dépend de votre régime fiscal (micro ou réel) et de votre situation au regard de la TVA.
  • Depuis le 1er septembre 2026, toute entreprise individuelle doit pouvoir recevoir des factures électroniques. L’obligation de les émettre arrive le 1er septembre 2027.
  • Les prix vont de 0 € pour les solutions gratuites à environ 50 € HT par mois pour les offres complètes.
  • LegalPlace Pro réunit compte professionnel, comptabilité automatisée et facturation conforme à partir de 11 € HT par mois.

Tenir la comptabilité d’une entreprise individuelle ne demande pas les mêmes outils selon que vous relevez du régime micro ou du régime réel. Un micro-entrepreneur a besoin d’un simple suivi de recettes, alors qu’une entreprise individuelle au réel doit produire un bilan comptable. Le bon logiciel de comptabilité pour votre entreprise individuelle est donc celui qui colle à votre régime, gère la TVA quand vous y êtes soumis et se met en conformité avec la facturation électronique qui se déploie en 2026 et 2027.

Comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour entreprise individuelle en 2026

Ce comparatif des logiciels de comptabilité pour entreprise individuelle retient sept critères qui pèsent au quotidien. On y trouve le prix, la conformité à la facturation électronique 2026, la synchronisation bancaire, la gestion de la TVA, la production des déclarations, la connexion avec un comptable et l’application mobile.

Plateforme Prix HT/mois (2026) Conformité facturation électronique Synchro. bancaire Gestion TVA Adapté au régime réel Comptable inclus
LegalPlace Pro (LegalPlace) À partir de 11 € Oui Oui Oui, déclaration automatisée Oui (bilan en option) Oui, par chat
Comptastart (Legalstart) À partir de 29,90 € Oui Oui Oui Oui En option
Sage 50 Compta Dès 18 € Oui Oui Oui Oui En option
Abby Gratuit à 24 € Oui Oui (offres payantes) Oui Limité Non
Indy Gratuit puis dès 22 € Non confirmée Oui Limitée Non Non
Tiime Gratuit, puis 17,99 à 24,99 € Oui Oui (offres payantes) Oui (offres payantes) Non Non
Freebe 15 € TTC (micro), 30 € TTC (EI) Oui Oui Oui Oui En option

*Prix hors taxes par mois constatés en août 2026, à destination de professionnels, susceptibles d’évoluer.

LegalPlace Pro pour votre entreprise individuelle

Interface LP Pro

LegalPlace Pro associe un compte professionnel et une comptabilité automatisée pensés pour les entrepreneurs individuels. L’offre démarre à 11 € HT par mois, et passe à 15 € HT par mois pour la version Premium qui ouvre droit à 30 jours de comptabilité offerts. La déclaration de TVA se prépare automatiquement, les dépenses se classent grâce à l’intelligence artificielle et un comptable reste joignable par chat. Un tableau de bord regroupe l’ensemble de vos chiffres et vous accédez à vos exercices passés. Le bilan est disponible en option pour les entreprises au réel. La solution intègre aussi la création de devis, la génération de factures professionnelles et le suivi de leur statut. Elle convient à un entrepreneur qui veut piloter sa gestion depuis un seul outil, sans multiplier les abonnements.

Ouvrir un compte pro en banque traditionnelle peut prendre plusieurs semaines et nécessiter un rendez-vous. Avec LegalPlace, votre compte professionnel est opérationnel en quelques minutes, directement en ligne.

Comptastart (Legalstart)

Comptastart legalstart

Comptastart, la solution comptable de Legalstart, s’adresse aux entrepreneurs qui gèrent eux-mêmes leur comptabilité. Le tarif est de 29,90 € HT par mois sans engagement. La plateforme centralise les données, collecte les justificatifs, détecte automatiquement la TVA et rapproche les opérations bancaires. Elle génère les factures à partir des devis et suit les relances clients. La préparation du bilan annuel reste une prestation optionnelle facturée à part, à partir de 600 €, via des comptables partenaires. Comptastart cible donc une entreprise individuelle autonome qui veut un suivi complet sans expert-comptable dédié.

Sage 50 Compta

Sage 50 Compta

Sage 50 Compta est une solution de comptabilité complète destinée aux TPE et aux entreprises individuelles au réel. Le tarif se situe entre 18 € HT et 24 € HT par mois selon la durée d’engagement. Le logiciel gère la comptabilité, la TVA, le rapprochement bancaire et les déclarations, avec la facturation électronique aux formats Factur-X et UBL. Un accès pour votre expert-comptable est possible via l’écosystème Sage et une application mobile permet un suivi à distance. Sage 50 Compta s’adresse à une entreprise individuelle qui tient une comptabilité complète, plus qu’à un micro-entrepreneur en franchise de TVA.

Abby

Abby

Abby cible les auto-entrepreneurs qui démarrent et cherchent un outil très simple. Une version gratuite couvre les devis, les factures illimitées et le livre de recettes automatique. Les offres payantes vont de 9 € HT par mois pour l’offre Pro à 26,40 € HT par mois pour l’offre Business, et ajoutent la gestion de la TVA et la synchronisation bancaire. Abby a été immatriculée comme plateforme agréée en janvier 2026, donc conforme à la facturation électronique. L’application mobile est disponible sur iOS et Android et le calcul des cotisations Urssaf se fait en temps réel. Abby convient moins si vous prévoyez de passer en société ou de tenir une comptabilité au réel.

Indy

Indy

Indy propose une offre gratuite qui couvre déjà les besoins de base d’une micro-entreprise ou d’une entreprise individuelle. La formule payante démarre à 22 € HT par mois selon le statut et le niveau de service. La synchronisation bancaire est automatique en lecture seule, la TVA est gérée avec ajustement des taux, et la facturation électronique est conforme grâce à une plateforme immatriculée. Les déclarations fiscales comme la 2035 ou la 2033 sont automatisées. L’application mobile est disponible sur iOS et Android. Indy est particulièrement apprécié des professions libérales et des indépendants qui veulent une prise en main rapide.

Tiime

Tiime

Tiime combine facturation, comptabilité et gestion des notes de frais. La version gratuite autorise les devis et factures illimités. Les offres payantes commencent à 17,99 € HT par mois pour un indépendant seul et montent à 24,99 € HT par mois pour la formule Business. La synchronisation bancaire est réservée aux offres payantes. La solution est immatriculée comme plateforme de dématérialisation partenaire, donc conforme à la facturation électronique 2026. Votre comptable accède gratuitement à votre compte, ce qui facilite la collaboration. Tiime convient aux entrepreneurs individuels qui travaillent déjà avec un cabinet.

Freebe

Freebe

Freebe est un logiciel simple destiné en priorité aux auto-entrepreneurs. Le tarif est de 15 € TTC par mois pour une micro-entreprise, avec un abonnement annuel à 12,50 € TTC par mois, et de 30 € TTC par mois pour une entreprise individuelle. L’outil gère les devis et factures conformes, suit la trésorerie, se connecte au compte bancaire et pré-remplit les déclarations Urssaf. La gestion de la TVA reste limitée et la conformité à la facturation électronique 2026 n’est pas confirmée à ce jour. Freebe s’adresse donc à un micro-entrepreneur en franchise de TVA qui cherche une gestion légère.

Quels critères pour choisir son logiciel de comptabilité en entreprise individuelle ?

La conformité à la réforme de la facturation électronique 2026

La conformité à la facturation électronique est le premier point à vérifier en 2026. Votre logiciel de comptabilité doit être relié à une plateforme de dématérialisation partenaire immatriculée par l’administration fiscale. Depuis le 1er septembre 2026, vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques de vos fournisseurs. À partir du 1er septembre 2027, vous devrez aussi émettre vos factures dans un format structuré comme Factur-X. Un logiciel non raccordé à une plateforme partenaire vous obligerait à changer d’outil en cours de route.

Xavier de Labarrière Expert-comptable, président de ComptaPlace Xavier de Labarrière

La facturation électronique est longtemps restée rangée dans la case des sujets pour plus tard. Le calendrier a changé la donne, et ce qui surprend, c’est qu’elle devient un critère de choix dès maintenant. Un logiciel qui n’est pas prêt sur ce point, c’est un outil qu’on risque de devoir remplacer avant même de l’avoir amorti.

La synchronisation bancaire

La synchronisation bancaire relie votre logiciel à votre compte professionnel et importe vos opérations en temps réel. Vous n’avez plus à saisir chaque encaissement ou chaque dépense à la main. Les écritures se rapprochent automatiquement des factures, ce qui réduit les oublis et les erreurs de report. Pour une entreprise individuelle qui gère seule sa comptabilité, cette fonction fait gagner plusieurs heures par mois.

La gestion de la TVA selon votre régime

La gestion de la TVA n’a pas le même poids pour tous les entrepreneurs individuels. En franchise en base, sous 85 000 € pour la vente et 37 500 € pour les services, vous facturez sans TVA et votre logiciel n’a qu’à suivre vos seuils. Dès que vous devenez redevable, l’outil doit calculer la TVA collectée, la TVA déductible et préparer vos déclarations. Vérifiez que le logiciel gère votre régime réel, simplifié ou normal. Le seuil qui vous dispense de facturer la taxe dépend de la franchise en base de TVA propre à votre activité.

La connexion avec un expert-comptable

La connexion avec un expert-comptable compte si vous êtes accompagné. Votre logiciel doit permettre à votre comptable d’accéder à vos données sans échange de fichiers par courriel. Certaines solutions offrent un accès dédié gratuit, d’autres intègrent directement un comptable joignable par chat. Cette collaboration fluide évite les ressaisies et accélère la clôture. Les formules varient selon que vous passez par un cabinet local ou un expert-comptable en ligne.

La génération des déclarations

Un bon logiciel produit vos déclarations à votre place. Pour un micro-entrepreneur, il pré-remplit la déclaration de chiffre d’affaires à l’Urssaf. Pour une entreprise individuelle au réel, il génère la liasse fiscale et la déclaration de TVA. Cette automatisation limite le risque d’erreur et vous fait gagner du temps aux échéances.

La facilité de prise en main et l’application mobile

Vous n’êtes pas comptable, donc l’outil doit rester lisible. Une interface claire, des catégories de dépenses prêtes à l’emploi et une application mobile vous permettent de suivre votre activité depuis votre téléphone. La possibilité de photographier un justificatif et de le rattacher à une dépense évite d’accumuler les tickets papier.

Le tarif et le rapport qualité-prix

Le prix ne fait pas tout, mais il compte pour une entreprise individuelle qui démarre. Comparez ce qui est inclus dans chaque offre. Une solution à 7 € par mois avec comptabilité automatisée peut suffire à une micro-entreprise, tandis qu’une entreprise au réel a intérêt à une offre plus complète avec bilan. Rapportez toujours le prix aux fonctions réellement utiles à votre situation.

Les obligations comptables spécifiques à l’entreprise individuelle

Une entreprise individuelle n’a pas de personnalité juridique distincte de l’entrepreneur, mais depuis 2022 son patrimoine professionnel est séparé de son patrimoine personnel. Cette séparation renforce l’intérêt d’une comptabilité claire, qui trace précisément ce qui relève de l’activité.

La comptabilité au régime micro

Au régime micro, vos obligations comptables sont réduites. L’article 50-0 du Code général des impôts fixe les plafonds du régime micro-BIC à 203 100 € pour la vente de marchandises et à 83 600 € pour les prestations de services sur la période 2026-2028. Tant que vous restez sous ces seuils, vous tenez un livre de recettes. Si vous exercez une activité de vente, vous ajoutez un registre des achats. Vous n’établissez ni bilan ni compte de résultat. Votre bénéfice imposable est calculé par un abattement forfaitaire de 71 % pour la vente, 50 % pour les services BIC et 34 % pour les activités libérales. Un logiciel adapté suit vos recettes et vous alerte quand vous approchez d’un seuil. Ces obligations rejoignent celles de la comptabilité de l’auto-entrepreneur, très proche de celle du micro-entrepreneur.

La comptabilité au régime réel

Au régime réel, vos obligations changent d’échelle. Vous tenez une comptabilité complète avec un livre-journal, un grand livre, un bilan et un compte de résultat. Chaque opération est enregistrée selon le plan comptable général. Votre résultat imposable correspond alors à vos recettes réelles diminuées de vos charges réelles, et non à un forfait. Ce régime concerne les entreprises individuelles qui dépassent les seuils du micro ou qui ont choisi le réel pour déduire leurs charges. Un logiciel capable de produire un bilan devient alors nécessaire. Ces règles relèvent de la comptabilité de l’entreprise individuelle au régime réel.

TVA, mentions obligatoires et conservation des factures

La TVA dépend de votre chiffre d’affaires. En dessous de 85 000 € pour la vente et de 37 500 € pour les services, vous bénéficiez de la franchise en base prévue par l’article 293 B du Code général des impôts et vous facturez sans TVA. Au-delà, vous devenez redevable et devez faire figurer la TVA sur vos factures. Chaque facture doit comporter des mentions précises comme votre numéro SIREN, la date, le détail des prestations et le taux de TVA applicable. L’article L123-22 du Code de commerce impose enfin de conserver vos livres et pièces comptables pendant 10 ans. Les factures électroniques se conservent dans leur format d’origine.

Une facture incomplète ou mal conservée peut être rejetée lors d’un contrôle. Un logiciel qui archive automatiquement vos factures au bon format vous protège sur ce point.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour votre entreprise individuelle selon votre profil ?

Micro-entrepreneur en franchise de TVA avec un faible volume

Si vous facturez peu et sans TVA, une solution gratuite ou peu coûteuse suffit. Vous avez besoin d’un suivi de recettes, d’une facturation simple et d’un pré-remplissage de la déclaration Urssaf. Une offre gratuite comme celle d’Indy ou d’Abby, ou une formule micro à quelques euros comme LP Pro, couvre ce besoin sans surcoût.

Julien est graphiste en micro-entreprise et relève du régime micro-BNC. Il facture une trentaine de clients par an, reste sous le seuil de franchise et ne collecte pas la TVA. Une solution gratuite avec suivi des recettes et déclaration Urssaf pré-remplie couvre l’intégralité de ses obligations, sans qu’il ait besoin d’un bilan.

Entreprise individuelle au réel soumise à la TVA

Dès que vous relevez du réel et collectez la TVA, vos besoins augmentent. Il vous faut une comptabilité complète, une gestion fine de la TVA déductible et la production d’un bilan. Une offre comme LegalPlace Pro avec bilan en option, ou une solution complète type Comptastart, correspond à ce profil. Sage 50 Compta convient aussi pour une comptabilité au réel plus lourde.

Entreprise individuelle avec ou sans expert-comptable

Si vous travaillez avec un comptable, privilégiez un logiciel qui lui donne un accès direct à vos données. Tiime et Indy offrent cet accès, et LegalPlace Pro intègre un comptable joignable par chat. Si vous gérez seul, misez sur l’automatisation des déclarations et la clarté de l’interface pour ne rien oublier aux échéances.

Entreprise individuelle en activité B2B ou B2C

Une activité B2B émet des factures à des entreprises et sera concernée dès 2027 par l’obligation d’émettre des factures électroniques. Un logiciel raccordé à une plateforme partenaire est donc prioritaire. Une activité B2C vend surtout à des particuliers et relève de l’e-reporting, la transmission des données de transaction à l’administration. LegalPlace Pro et Comptastart couvrent les deux cas, de la facturation aux professionnels à l’e-reporting des ventes aux particuliers. Vérifiez que votre outil gère le cas qui vous concerne.

Combien coûte un logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle ?

Le budget d’un logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle va de 0 € à environ 50 € HT par mois. Les micro-entrepreneurs trouvent des solutions gratuites ou à moins de 15 € par mois. Les entreprises au réel, qui ont besoin d’un bilan et d’une gestion de TVA complète, se situent plutôt entre 10 € et 50 € par mois. En ajoutant l’accompagnement d’un comptable, le coût mensuel grimpe généralement entre 60 € et 150 €.

Type de solution Coût indicatif (2026) Pour qui
Logiciel gratuit ou freemium 0 € Micro-entreprise à faible volume
Logiciel en ligne pour EI 7 à 30 € HT/mois Micro et réel simplifié
Logiciel avec bilan et TVA complète 30 à 50 € HT/mois Entreprise individuelle au réel
Logiciel et accompagnement comptable 60 à 150 €/mois Réel avec accompagnement complet

*Prix hors taxes par mois constatés en août 2026, à destination de professionnels, susceptibles d’évoluer.

Le meilleur logiciel de comptabilité pour une entreprise individuelle est celui qui correspond à votre régime et à votre situation de TVA, tout en étant prêt pour la facturation électronique de 2026 et 2027. LegalPlace Pro se distingue par son offre tout-en-un à partir de 11 € HT par mois, qui associe compte professionnel, comptabilité automatisée et facturation conforme. Comptastart de Legalstart propose un suivi complet à 29,90 € HT par mois. Indy, Tiime et Abby offrent des versions gratuites intéressantes pour démarrer, Freebe reste une option légère pour les micro-entrepreneurs et Sage 50 Compta vise les entreprises au réel avec des besoins comptables plus lourds. Comparez d’abord les fonctions utiles à votre activité, puis le prix.

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Samuel Goldstein

Samuel est co-fondateur de LegalPlace et responsable du contenu éditorial. L’ambition est de rendre accessible le savoir-faire juridique au plus grand nombre grâce à un contenu simple et de qualité. Samuel est diplômé de Supelec et de HEC Paris

Dernière mise à jour le 11/08/2026

FAQ

Puis-je avoir un logiciel de comptabilité gratuit pour mon entreprise individuelle ?

Oui. Plusieurs solutions comme Indy ou Tiime proposent une version gratuite qui couvre le suivi des recettes, la facturation et parfois la déclaration Urssaf. Ces offres conviennent surtout aux micro-entrepreneurs à faible volume. Dès que vous devez gérer la TVA au réel ou produire un bilan, une version payante devient nécessaire.

Une entreprise individuelle est-elle obligée d'utiliser un logiciel de comptabilité ?

Non, aucun texte n’impose un logiciel. Vous êtes libre de tenir votre comptabilité autrement. Le logiciel devient toutefois très utile pour respecter vos obligations, préparer vos déclarations et, à partir de 2026, gérer la facturation électronique. En pratique, il sécurise votre gestion et vous fait gagner du temps.

Peut-on tenir la comptabilité de son entreprise individuelle sur Excel ?

Au régime micro, un tableur reste possible pour votre livre de recettes tant que vos données sont fiables et conservées. Au régime réel, Excel montre vite ses limites car vous devez produire un bilan et une liasse fiscale. La facturation électronique de 2026 impose de plus des formats structurés qu’un tableur ne génère pas. Un logiciel dédié devient alors la solution la plus adaptée.

Mon logiciel doit-il être conforme à la facturation électronique 2026 ?

Oui, si vous facturez des professionnels. Depuis le 1er septembre 2026, vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques. À compter du 1er septembre 2027, vous devrez aussi les émettre via une plateforme de dématérialisation partenaire. Choisir dès maintenant un logiciel raccordé à une telle plateforme vous évite de changer d’outil. Chaque échéance est détaillée dans le calendrier de la facturation électronique.

Quel logiciel de comptabilité pour un auto-entrepreneur ?

Un auto-entrepreneur a besoin d’un outil simple qui suit ses recettes, édite ses factures et pré-remplit sa déclaration Urssaf. Les solutions gratuites d’Indy ou de Tiime, ou une formule micro de Freebe, répondent à ce besoin. LegalPlace Pro convient aussi si vous souhaitez associer compte professionnel et comptabilité dès le départ.

Un logiciel de comptabilité remplace-t-il un expert-comptable ?

Pas toujours. Au régime micro, un logiciel suffit dans la plupart des cas car vos obligations sont réduites. Au régime réel, l’accompagnement d’un professionnel reste utile pour le bilan et les choix fiscaux. Beaucoup d’entrepreneurs combinent les deux, avec un logiciel pour le quotidien et un comptable pour la clôture annuelle.

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Rédigé par

Samuel Goldstein

Samuel est co-fondateur de LegalPlace et responsable du contenu éditorial. L'ambition est de rendre accessible le savoir-faire juridique au plus grand nombre grâce à un contenu simple et de qualité. Samuel est diplômé de Supelec et de HEC Paris