Quel logiciel de facturation choisir pour son entreprise individuelle en 2026 ?

Gérer la facturation d’une entreprise individuelle demande davantage de rigueur que pour une micro-entreprise. Au régime réel, l’entrepreneur individuel doit tenir une comptabilité complète, gérer la TVA, produire des comptes annuels et respecter des délais de paiement réglementés. Un bon logiciel de facturation n’est pas seulement un outil pratique, c’est un outil pour sécuriser sa conformité, gagner du temps sur les tâches administratives et préparer sereinement ses obligations fiscales. En 2026, la réforme de la facturation électronique ajoute une contrainte supplémentaire qui rend le choix du bon outil encore plus décisif pour les entrepreneurs individuels.

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation pour entreprise individuelle en 2026

Tarifs constatés en juin 2026, susceptibles d’évoluer.

LP Pro pour son entreprise individuelle

LP Pro est la solution de LegalPlace dédiée aux indépendants et entrepreneurs individuels souhaitant centraliser facturation, comptabilité et gestion bancaire dans un seul espace. Disponible à partir de 9,90 € HT par mois ou 99 € HT par an (soit 8,25 € HT par mois), l’offre intègre un compte professionnel, la création illimitée de devis et factures conformes, la gestion de la TVA, les relances automatiques et une connexion directe avec un expert-comptable via ComptaPlace.

Pensée pour les non-comptables, l’interface permet de créer une facture en moins d’une minute et de suivre ses encaissements en temps réel depuis un tableau de bord centralisé. Pour les entrepreneurs individuels au régime réel, l’accès à un expert-comptable intégré est un atout particulièrement précieux pour la clôture des comptes annuels.

Au-delà du logiciel de facturation, LegalPlace propose un écosystème complet de services pour accompagner l’entrepreneur individuel tout au long de la vie de son entreprise, tels que la domiciliation, le dépôt de capital, la comptabilité, le compte pro et l’assurance RC Pro, ce qui permet de gérer l’ensemble de son activité depuis un seul interlocuteur.

LS Compta pour son entreprise individuelle

LS Compta propose une offre intégrée qui combine compte professionnel, facturation et suivi comptable dans une interface unique. La facturation est incluse sans surcoût dans l’abonnement au compte pro, avec gestion de la TVA, relances automatiques et synchronisation avec un expert-comptable. Conforme à la réforme de la facturation électronique 2026, LS Compta convient aux entrepreneurs individuels qui souhaitent réduire le nombre d’outils et gérer leur activité depuis un seul point d’entrée.

Qonto pour son entreprise individuelle

Qonto est un compte professionnel enrichi d’outils de facturation et de gestion financière, particulièrement adapté aux entrepreneurs individuels qui réalisent un volume élevé d’opérations bancaires. Plateforme Agréée (PDP) par la DGFiP, Qonto permet de créer des devis et factures en illimité, d’automatiser les relances clients et de faciliter la collaboration avec un expert-comptable via des exports comptables dédiés. Son interface mobile soignée en fait une référence pour les entrepreneurs qui gèrent leur activité en déplacement.

Pennylane pour son entreprise individuelle

Pennylane est particulièrement bien positionnée pour les entrepreneurs individuels au régime réel, qui ont des besoins comptables plus avancés que les micro-entrepreneurs. La plateforme réunit facturation, comptabilité et pilotage de trésorerie dans un espace unique, avec une collaboration en temps réel avec l’expert-comptable. Ses automatisations de rapprochements bancaires, de catégorisation des opérations et de suivi des encaissements permettent de gagner un temps considérable sur les tâches à faible valeur ajoutée. Elle est particulièrement adaptée aux entrepreneurs individuels qui anticipent une croissance de leur activité ou envisagent de passer en société.

Indy pour son entreprise individuelle

Indy est une plateforme française de facturation et comptabilité pour indépendants, reconnue comme Plateforme Agréée (PDP) par la DGFiP. Son offre gratuite inclut devis et factures en illimité, un compte bancaire pro avec IBAN français et une carte Mastercard. L’offre payante à partir de 22,90 € HT par mois ajoute la comptabilité complète, l’automatisation des déclarations TVA et des déclarations de chiffre d’affaires, et la connexion avec un expert-comptable. Le niveau d’automatisation comptable d’Indy est particulièrement adapté aux entrepreneurs individuels souhaitant réduire au maximum le temps consacré à leurs obligations administratives.

Tiime pour son entreprise individuelle

Tiime est une plateforme de facturation et comptabilité dédiée aux indépendants, Plateforme Agréée (PDP) par la DGFiP. Son offre gratuite permet de créer des devis et factures en illimité avec un e-invoicing natif dès la version gratuite. La version payante enrichit l’offre de fonctionnalités comptables, de relances automatiques et d’une collaboration facilitée avec l’expert-comptable. Pour un entrepreneur individuel en phase de démarrage avec un budget limité, Tiime offre un excellent point d’entrée.

Abby pour son entreprise individuelle

Abby est un logiciel tout-en-un de facturation et comptabilité, Plateforme Agréée (PDP) par la DGFiP dès son offre gratuite. Elle convient aux entrepreneurs individuels qui souhaitent centraliser facturation et comptabilité de base sans frais initiaux, avec la possibilité d’évoluer vers une offre payante au fil du développement de leur activité.

Quels critères pour choisir son logiciel de facturation en entreprise individuelle ?

Un entrepreneur individuel a des besoins différents d’un micro-entrepreneur, des obligations comptables plus étendues, la gestion de la TVA souvent obligatoire et la production de comptes annuels. Ces spécificités doivent guider le choix du logiciel.

La conformité à la réforme de la facturation électronique 2026

La conformité à la réforme de la facturation électronique de 2026 est le critère prioritaire en 2026. Tout entrepreneur individuel assujetti à la TVA devra recevoir des factures électroniques dès septembre 2026 et en émettre dès septembre 2027. Optez systématiquement pour un logiciel référencé comme Plateforme Agréée (PDP) ou connecté à une PDP agréée par la DGFiP pour éviter une migration forcée.

La gestion complète de la TVA

Contrairement à la majorité des micro-entrepreneurs, l’entrepreneur individuel au régime réel est généralement redevable de la TVA dès le démarrage de son activité. Le logiciel choisi doit gérer la TVA collectée et déductible, automatiser les déclarations et permettre le suivi de la TVA sur débits ou sur encaissements selon le régime applicable.

La compatibilité avec les obligations comptables au régime réel

Au régime réel, l’entrepreneur individuel doit tenir une comptabilité complète et produire des comptes annuels. Un logiciel qui facilite la saisie des opérations, le rapprochement bancaire et l’export des données vers un expert-comptable représente un gain de temps majeur sur ces obligations.

La connexion avec un expert-comptable

La production des comptes annuels d’un entrepreneur individuel au régime réel nécessite généralement l’intervention d’un expert-comptable. Choisissez un logiciel qui permet de partager vos données en temps réel avec votre comptable pour éviter les ressaisies et les erreurs en fin d’exercice.

Le tarif et le rapport qualité/prix

Les besoins d’un entrepreneur individuel étant plus étendus que ceux d’un micro-entrepreneur, les offres gratuites couvrent rarement l’ensemble des fonctionnalités nécessaires. Les solutions payantes à partir de 8 à 10 € HT par mois offrent en général un rapport qualité/prix très satisfaisant au regard du temps gagné et des erreurs évitées.

Les obligations de facturation spécifiques à l’entreprise individuelle

Les mentions obligatoires sur les factures d’un entrepreneur individuel

Une facture d’entrepreneur individuel doit obligatoirement mentionner le nom et le prénom suivis de la mention “EI” ou “Entrepreneur Individuel”, le numéro SIRET, l’adresse de domiciliation, la date d’émission et le numéro de facture, la description précise des prestations ou produits, le montant HT et TTC avec le taux de TVA applicable, ainsi que le numéro individuel d’identification à la TVA pour les factures adressées à des professionnels.

À partir du 1er septembre 2027, quatre nouvelles mentions obligatoires s’ajouteront pour les entrepreneurs individuels dans le cadre de la réforme de la facturation électronique, en application du décret n° 2022-1299 (article 242 nonies A du CGI). Le numéro SIREN de l’acheteur devra figurer sur la facture, en plus du numéro SIRET du vendeur déjà obligatoire. L’adresse de livraison des biens devra être précisée lorsqu’elle est différente de l’adresse du client. La nature de l’opération devra indiquer s’il s’agit d’une livraison de biens, d’une prestation de services ou des deux à la fois. Enfin, la mention “option pour le paiement de la taxe d’après les débits” devra apparaître lorsque l’entrepreneur a opté pour ce mode de paiement de la TVA.

Le régime de TVA de l’entrepreneur individuel

L’entrepreneur individuel au régime réel est en principe redevable de la TVA dès lors qu’il dépasse les seuils de franchise en base, et souvent dès la création si son activité le justifie. Il doit facturer la TVA à ses clients, la déclarer périodiquement et la reverser à l’administration fiscale. Le logiciel de facturation doit impérativement prendre en charge cette gestion, notamment le choix entre TVA sur débits et TVA sur encaissements selon le régime applicable à son activité.

La conservation des factures

Les factures d’un entrepreneur individuel doivent être conservées pendant 10 ans minimum à compter de leur date d’émission, qu’elles soient papier ou électroniques. Un logiciel de facturation avec archivage sécurisé permet de satisfaire cette obligation sans effort.

Quel est le meilleur logiciel de facturation pour mon entreprise individuelle selon mon profil ?

Vous démarrez votre activité avec un budget limité

Tiime ou Abby sont les solutions gratuites conformes à la réforme 2026 les mieux adaptées pour un démarrage sans frais. Indy (version gratuite) ajoute en prime un compte bancaire pro.

Vous souhaitez tout gérer depuis un seul outil (facturation, comptabilité et compte pro)

LP Pro centralise facturation, compte pro et accompagnement comptable dans un seul espace à partir de 8,25 € HT par mois. LS Compta propose une alternative similaire avec la facturation incluse dans le compte pro.

Vous avez des besoins comptables avancés et un expert-comptable

Pennylane est la référence pour la collaboration en temps réel avec un expert-comptable, le rapprochement bancaire automatisé et le pilotage de trésorerie. LP Pro et Indy offrent également cette fonctionnalité.

Vous facturez principalement des professionnels (B2B) et devez être conforme à la réforme 2026

Privilégiez une Plateforme Agréée (PDP) par la DGFiP comme LP Pro, LS Compta, Tiime, Abby, Indy ou Qonto pour être conforme à l’obligation d’émission dès septembre 2027.

Vous souhaitez centraliser compte professionnel et facturation dans une néobanque

Qonto est la référence sur ce segment, avec une PDP agréée, une facturation illimitée et une application mobile complète intégrées au compte pro. LP Pro est également une option à considérer pour les entrepreneurs qui souhaitent combiner compte pro et logiciel de facturation au sein d’un même écosystème en combinant création d’entreprise, compte pro et logiciel de facturation chez LegalPlace, le dépôt de capital est offert, ce qui représente un avantage financier concret dès le lancement de l’activité.

Vous anticipez une croissance rapide ou un passage en société

Pennylane est la solution à privilégier pour sa capacité à accompagner des structures plus complexes, avec un tableau de bord de pilotage financier adapté aux ambitions de développement.

Combien coûte un logiciel de facturation pour entreprise individuelle ?

Les besoins d’un entrepreneur individuel au régime réel justifient généralement d’investir dans une solution payante, même si des offres gratuites existent pour les profils aux besoins simples.

Tarifs constatés en juin 2026, susceptibles d’évoluer.

FAQ

Mehdi Ouchallal

Co-fondateur LegalPlace, Mehdi est diplômé du magistère DJCE et avocat. Il a exercé plus de 12 ans au sein de cabinets anglo-saxons et français en droit des sociétés, fusions-acquisition et capital investissement.

Dernière mise à jour le 22/06/2026

Sources de l'article

• Ordonnance n° 2021-1190 du 15 septembre 2021 – Généralisation de la facturation électronique
• Décret n° 2022-1299 du 7 octobre 2022 – Modalités de la facturation électronique
• LOI n° 2026-103 du 19 février 2026, article 123 – Sanctions relatives à la facturation électronique
• Article L441-9 du Code de commerce – Obligations de facturation