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    • Un auto-entrepreneur a droit aux indemnités journalières (IJ) du régime obligatoire de la Sécurité sociale s’il est affilié depuis au moins un an et a un revenu annuel supérieur à 4 806 € (10 % du PASS 2026).
    • Le montant des indemnités journalières du régime obligatoire est limité à 1/730e du revenu moyen des 3 dernières années, soit au maximum 65,84 € par jour en 2026.
    • Un délai de carence de 7 jours s’applique en cas de maladie ou d’accident pour les auto-entrepreneurs affiliés à la SSI, et 3 jours en cas d’hospitalisation.
    • Souscrire une assurance IJ complémentaire peut être intéressant pour l’auto-entrepreneur afin de compenser le faible niveau des indemnités journalières du régime obligatoire et maintenir son niveau de vie en cas d’arrêt prolongé.
    • Les auto-entrepreneurs en profession libérale affiliés à la CIPAV bénéficient également des indemnités journalières depuis la loi de financement de la Sécurité Sociale de 2021.

Un arrêt de travail prolongé représente un risque financier pour un auto-entrepreneur. Les indemnités journalières du régime obligatoire existent mais restent souvent insuffisantes. Elles sont plafonnées, soumises à conditions et assorties d’un délai de carence. C’est précisément pour combler ces lacunes que l’assurance indemnités journalières complémentaire peut être intéressante comme protection sociale pour un auto-entrepreneur.

Un auto-entrepreneur a-t-il droit aux indemnités journalières ?

Un auto-entrepreneur a droit aux indemnités journalières en cas d’arrêt de travail  (maladie, accident, congé maternité ou paternité, adoption), à condition de remplir plusieurs critères cumulatifs. Ces indemnités journalières sont versées par la SSI (Sécurité Sociale des Indépendants) pour les artisans, commerçants et professions libérales non réglementées, ou par la CPAM en cas de cumul avec une activité salariée.

Les conditions pour bénéficier des indemnités journalières en tant qu’auto-entrepreneur

Pour percevoir des indemnités journalières en tant qu’auto-entrepreneur, il faut :

  • être affilié à la Sécurité sociale des indépendants (SSI) depuis au moins un an,
  • être à jour du paiement de ses cotisations sociales,
  • disposer d’un revenu annuel moyen supérieur à 4 806 € sur les 3 dernières années (soit 10 % du PASS 2026 fixé à 48 060 €),
  • exercer son activité au moment de l’arrêt de travail ou être en maintien de droits.
Si le revenu annuel moyen des 3 dernières années est inférieur à 4 806 €, aucune indemnité journalière ne sera versée à l’auto-entrepreneur, quelle que soit la durée de l’ arrêt maladie. Pour un auto-entrepreneur en activité commerciale, cela correspond à un chiffre d’affaires minimum d’environ 16 572 € avant abattement de 71 %. Pour une activité libérale BNC, cela correspond à environ 7 282 € de CA avant abattement de 34 %.

Cas particuliers : les indemnités journalières pour un auto-entrepreneur affilié à la CIPAV et salarié

Depuis la loi de financement de la Sécurité Sociale de 2021, les auto-entrepreneurs en profession libérale affiliés à la CIPAV bénéficient également des indemnités journalières en cas d’arrêt maladie, dans les mêmes conditions que les artisans et commerçants. Avant cette réforme, les professions libérales relevant de la CIPAV n’y avaient pas droit.

En cas de cumul d’une activité salariée et d’auto-entrepreneur , les indemnités journalières sont versées par la CPAM et calculées uniquement sur la base du salaire, sans prise en compte des revenus de la micro-entreprise. Des conditions spécifiques s’appliquent pour bénéficier des indemnités journalières selon la durée de l’arrêt. Pour un arrêt inférieur à 6 mois, il faut justifier d’au moins 150 heures de travail au cours des 3 derniers mois ou avoir cotisé sur un salaire équivalent à 1 015 fois le SMIC horaire au cours des 6 derniers mois. Pour un arrêt supérieur à 6 mois, il faut justifier de 600 heures de travail sur les 12 derniers mois et d’une affiliation à l’Assurance maladie depuis au moins 12 mois.

Le montant des indemnités journalières versées à l’auto-entrepreneur

Le montant de l’indemnité journalière versée à l’auto-entrepreneur correspond à 1/730e de son revenu moyen des 3 dernières années civiles. Ce revenu est calculé après application de l’abattement forfaitaire applicable à l’activité, soit 71 % pour les activités commerciales, 50 % pour les prestations de services BIC et 34 % pour les activités libérales BNC. En 2026, le montant maximum des indemnités journalières s’élève à 65,84 € par jour, soit 1/730e du plafond de revenu retenu par la SSI.

Revenu moyen insuffisant : Karim est auto-entrepreneur en vente de marchandises et réalise un chiffre d’affaires annuel moyen de 10 000 € sur 3 ans. Après abattement de 71 %, son revenu moyen s’élève à 2 900 €, inférieur au seuil de 4 806 €. Il ne perçoit aucune indemnité journalière en cas d’arrêt maladie.
Revenu moyen éligible : Sophie est consultante libérale (BNC) et réalise un  chiffre d’affaires annuel moyen de 30 000 € sur 3 ans. Après abattement de 34 %, son revenu moyen s’élève à 19 800 €. Son indemnité journalière s’élève à 19 800 € ÷ 730 = 27,12 € par jour.
Revenu élevé : Thomas est prestataire de services BIC et réalise un  chiffre d’affaires annuel moyen de 60 000 € sur 3 ans. Après abattement de 50 %, son revenu moyen s’élève à 30 000 €. Son indemnité journalière s’élève à 30 000 € ÷ 730 = 41,10 € par jour.

Pourquoi souscrire une assurance indemnités journalières complémentaire en tant qu’auto-entrepreneur ?

Une assurance indemnités journalières complémentaire permet de combler les lacunes du régime obligatoire, en garantissant un niveau d’indemnisation adapté au niveau de revenus réel de l’auto-entrepreneur, dès le premier jour d’arrêt selon le contrat choisi et sans condition de seuil de revenu minimum.

Tout d’abord, comme le montant des indemnités journalières de l’auto-entrepreneur est limité, avec un plafond de 65,84 € par jour en 2026, un auto-entrepreneur réalisant 50 000 € de chiffre d’affaires annuel percevra une indemnité journalière bien inférieure à son niveau de revenu habituel.

De plus, le délai de carence de 7 jours signifie qu’une semaine d’arrêt n’ouvre aucun droit au versement d’indemnités journalières pour l’auto-entrepreneur.

Un délai de carence s’applique avant le versement des premières indemnités journalières. Pour les auto-entrepreneurs affiliés à la SSI, ce délai est de 7 jours en cas de maladie ou d’accident et de 3 jours en cas d’hospitalisation ou d’arrêt de plus de 7 jours. Pour les auto-entrepreneurs affiliés à la CPAM en cas de cumul avec une activité salariée, le délai de carence est de 3 jours. Ce délai de carence est supprimé en cas d’arrêt prolongé dans le cadre d’une affection de longue durée, de grossesse pathologique ou de nouvel arrêt de travail faisant suite à un accident.

Le seuil de revenu minimum de 4 806 € exclut également du bénéfice des indemnités journalières les auto-entrepreneurs aux revenus modestes ou dont le chiffre d’affaires est encore faible au démarrage.

Enfin, aucune indemnité journalière n’est versée pendant les 12 premiers mois d’activité de l’auto-entrepreneur, une période particulièrement vulnérable pour les nouveaux créateurs.

Claire est graphiste en micro-entreprise et réalise 40 000 € de chiffre d’affaires annuel. Sans assurance complémentaire, elle perçoit 36,16 € par jour d’indemnités journalières du régime obligatoire après le délai de carence de 7 jours, soit environ 1 085 € par mois. Avec une assurance IJ complémentaire à 60 € par mois, elle peut porter son indemnisation à 100 € par jour, soit environ 3 000 € par mois, et maintenir son niveau de vie pendant toute la durée de son arrêt.

Quelle assurance indemnités journalières choisir en tant qu’auto-entrepreneur ?

Le choix d’une assurance indemnités journalières (IJ) complémentaire dépend du profil de l’auto-entrepreneur, de son niveau de revenus et du niveau de protection souhaité.

Les garanties à vérifier de l’assurance  indemnités journalières pour un auto-entrepreneur

Le montant des indemnités journalières complémentaires est le premier critère à vérifier avant de souscrire une assurance indemnités journalières pour un auto-entrepreneur. Il doit être suffisant pour couvrir la différence entre les indemnités journalières du régime obligatoire et les revenus habituels de l’auto-entrepreneur. Le délai de carence est également déterminant. Certains contrats prévoient une prise en charge dès le premier jour d’arrêt, d’autres à partir du 8e ou du 15e jour. La durée maximale d’indemnisation définit combien de temps les indemnités journalières seront versées en cas d’arrêt prolongé. Enfin, les exclusions de garantie (pathologies préexistantes, sports à risque, affections psychiques ou dorsales) doivent être lues attentivement avant de souscrire.

Les critères de l’assurance indemnités journalières à choisir selon le profil de l’auto-entrepreneur

Un jeune auto-entrepreneur qui démarre son activité avec peu de charges fixes n’a pas les mêmes besoins en termes d’indemnités journalières qu’un auto-entrepreneur installé depuis plusieurs années avec des personnes à charge et un niveau de revenus stable. De même, un indépendant dont l’activité nécessite une présence physique quotidienne (artisan, photographe, coach sportif) sera bien plus exposé au risque d’arrêt que quelqu’un dont l’activité peut être partiellement maintenue à distance. Il est donc essentiel d’évaluer son niveau d’exposition au risque, ses charges fixes mensuelles et sa capacité à absorber une baisse de revenus avant de choisir son contrat.

Profil Priorité Garanties essentielles
Jeune auto-entrepreneur débutant Budget maîtrisé IJ à partir du 8e jour + capital décès minimum
Auto-entrepreneur avec charges fixes importantes Protection revenus IJ élevées dès le 1er jour + couverture charges fixes
Auto-entrepreneur avec personnes à charge Protection familiale IJ élevées + rente invalidité + capital décès
Auto-entrepreneur senior Couverture longue durée Contrat à tarif non évolutif + invalidité totale

Les principales offres d’assurance indemnités journalières pour auto-entrepreneur

Plusieurs assureurs proposent des contrats d’assurance indemnités journalières (IJ) adaptés aux auto-entrepreneurs, tels qu’April, AXA, Malakoff Humanis, Entoria, Alptis, SwissLife, Wemind et Easyblue. Les prestations, les délais de carence et les tarifs varient considérablement d’un assureur à l’autre. Il est nécessaire de comparer plusieurs devis avant de s’engager.

Le saviez-vous ? Comparer les assurances professionnelles est souvent complexe (franchises, plafonds, exclusions…). LegalPlace simplifie cette démarche et vous oriente vers les meilleures options en fonction de votre activité et de votre statut juridique. 

Quel est le prix d’une assurance indemnités journalières pour un auto-entrepreneur ?

Le tarif d’une assurance indemnités journalières (IJ) pour auto-entrepreneur varie entre 20 € et 80 € par mois pour un jeune assuré, selon le niveau d’indemnisation souhaité et les garanties choisies. Voici les fourchettes indicatives par profil :

Profil Tarif mensuel indicatif Niveau d’IJ couvert
Jeune auto-entrepreneur (moins de 30 ans) 20 € à 35 € 30 € à 50 € d’IJ par jour
Auto-entrepreneur 30-45 ans 35 € à 60 € 50 € à 100 € d’IJ par jour
Auto-entrepreneur 45-60 ans 60 € à 120 € 80 € à 150 € d’IJ par jour

Plusieurs critères influencent directement le montant de l’assurance indemnités journalières (IJ) pour un auto-entrepreneur. L’âge de l’assuré est le facteur le plus déterminant. Plus l’assuré est âgé, plus la prime est élevée. Le montant des indemnités journalières souhaitées et la durée maximale d’indemnisation font également varier le tarif. Le délai de carence choisi joue un rôle important. Un délai court (premier jour) implique une prime plus élevée qu’un délai de 15 ou 30 jours. L’activité exercée et ses risques spécifiques, les antécédents médicaux et les garanties optionnelles complètent la liste des critères.

Certains assureurs proposent des tarifs non évolutifs. La cotisation ne change pas avec l’âge. Ce type de contrat est particulièrement avantageux pour les auto-entrepreneurs qui souscrivent tôt dans leur carrière.
    • Un auto-entrepreneur a droit aux indemnités journalières du régime obligatoire sous conditions, mais leur montant, plafonné à 65,84 € par jour en 2026, est souvent insuffisant pour maintenir son niveau de vie en cas d’arrêt prolongé. Souscrire une assurance indemnités journalières (IJ) complémentaire peut être nécessaire pour combler les lacunes du régime obligatoire. Le tarif varie entre 20 € et 120 € par mois selon l’âge et le niveau de protection souhaité. Comparer plusieurs devis et vérifier les délais de carence et les exclusions avant de souscrire est essentiel pour trouver le contrat le mieux adapté.

FAQ

Un auto-entrepreneur peut-il travailler pendant un arrêt maladie ?

En principe, un auto-entrepreneur en arrêt maladie doit cesser toute activité professionnelle. En revanche, un salarié en arrêt maladie peut créer une micro-entreprise pendant cette période, sous réserve de respecter plusieurs conditions, à savoir ne pas exercer une activité similaire à celle objet de l'arrêt, respecter les horaires de présence à domicile imposés, ne pas exercer une activité concurrente à celle de son employeur et vérifier que son contrat de travail ne comporte pas de clause restrictive à l'égard de l'exercice d'une activité indépendante.

Un auto-entrepreneur peut-il se mettre en arrêt maladie ?

Oui, un auto-entrepreneur peut déclarer un arrêt maladie en cas d'incapacité de travail. Il peut bénéficier d'indemnités journalières versées par la SSI ou la CPAM, à condition d'être affilié depuis au moins un an, d'être à jour de ses cotisations et de disposer d'un revenu annuel moyen supérieur à 4 806 € sur les 3 dernières années.

Comment déclarer un arrêt de travail en tant qu'auto-entrepreneur ?

L'auto-entrepreneur doit transmettre les volets 1 et 2 de son avis d'arrêt de travail à la SSI ou à la CPAM dont il dépend dans un délai maximum de 48 heures après la date de l'arrêt, par courrier ou via ameli.fr. En cas de cumul avec une activité salariée, l'employeur doit également transmettre à la CPAM le formulaire Cerfa 11135*04.

Quel est le délai de carence pour les indemnités journalières d'un auto-entrepreneur ?

Pour les auto-entrepreneurs affiliés à la SSI, le délai de carence est de 7 jours en cas de maladie ou d'accident et de 3 jours en cas d'hospitalisation. Ce délai est supprimé en cas d'affection de longue durée, de grossesse pathologique ou de prolongation d'un arrêt faisant suite à un accident.

Les professions libérales ont-elles droit aux indemnités journalières en micro-entreprise ?

Oui, depuis la loi de financement de la Sécurité Sociale de 2021, les professions libérales affiliées à la CIPAV bénéficient des indemnités journalières en cas d'arrêt maladie dans les mêmes conditions que les artisans et commerçants. Les professions libérales non réglementées affiliées à la SSI y ont également droit dans les mêmes conditions.

Un salarié en arrêt maladie peut-il créer une micro-entreprise ?

Oui, un salarié en arrêt maladie peut créer une micro-entreprise, sous réserve de ne pas exercer une activité similaire à celle objet de l'arrêt, de respecter les horaires de présence à domicile imposés et de vérifier que son contrat de travail ne comporte pas de clause restrictive. Il continuera à percevoir ses indemnités journalières au titre de son activité salariée.
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Samuel Goldstein

Samuel est co-fondateur de LegalPlace et responsable du contenu éditorial. L’ambition est de rendre accessible le savoir-faire juridique au plus grand nombre grâce à un contenu simple et de qualité. Samuel est diplômé de Supelec et de HEC Paris

Dernière mise à jour le 01/06/2026

Sources de l'article

82 Commentaires
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Bonjour, j’ai ouvert mon EI en novembre 2024, salariée jusqu’au 28/02/2025 puis uniquement en EI. A ce jour, je bénéficie de la mutuelle de mon époux et suis au RSI. Je ne sais pas à quelle date je suis passé sur ce régime. Si je me retrouver en arrêt de travail, est ce que la sécurité sociale me versera des indemnités ? Il me semble qu’il faut être au RSI depuis au moins un an… et vu que mon salariat s’est arrêté fin février 2025 et que je bénéficié du régime général pendant 1 an je suppose donc que je… Lire la suite »

Bonjour, En tant qu’entrepreneur individuel, votre protection sociale est désormais gérée par la Sécurité sociale des indépendants (ex-RSI). Depuis la loi de financement de la sécurité sociale, un maintien de droits est prévu lors d’une transition entre le salariat et l’indépendance. Si vous justifiez d’une activité professionnelle minimale (salariée ou non) depuis au moins 12 mois, vous pouvez en principe prétendre à des indemnités journalières en cas d’arrêt de travail, sous réserve du paiement de vos cotisations et d’un revenu annuel suffisant. La période de transition entre votre fin de contrat de travail et le plein exercice de votre entreprise… Lire la suite »

Bonjour, je auto entrepreneur depuis plus de 6 ans, Je viens de subir une operation du dos et qui m’oblige d’être en arrêt de travail pour environ 4 a 6 mois. Ma question est ce que je peu continuer a toucher les indemnités journalier et arrêter mon entreprise? merci a tous

Bonjour, En tant qu’auto-entrepreneur, le versement des indemnités journalières par la Sécurité sociale des indépendants est conditionné par le maintien de votre activité professionnelle au moment de l’arrêt. Si vous procédez à la cessation définitive de votre entreprise pendant votre convalescence, vous perdez votre statut d’assuré social en tant qu’indépendant, ce qui entraîne généralement l’interruption du versement de vos prestations. Pour continuer à percevoir ces indemnités jusqu’au terme de votre arrêt de travail, il est donc nécessaire de ne pas clôturer officiellement votre micro-entreprise avant la fin de votre période d’incapacité. Nous vous invitons à prendre contact avec un avocat… Lire la suite »

J’ai créé ma micro entreprise fin septembre et je suis toujours inscrit à france travail avec l’accompagnement acre.
J’ai réalisé o€ de CA.
En novembre je tombe malade avec hospitalisation et la sécu me dit qu’elle ne me prend pas en charge, sachant que le post opératoire va au moins durer 3 mois.
Pouvez vous m’éclairer par rapport à cette situation ?
Merci.

Bonjour,

En principe, un micro-entrepreneur en début d’activité, même bénéficiaire de l’ACRE, doit justifier d’un revenu d’activité minimum pour ouvrir droit aux indemnités journalières maladie, conformément aux articles L. 622-1 et R. 622-3 du Code de la sécurité sociale.

En l’absence de chiffre d’affaires déclaré, aucun revenu cotisé n’est pris en compte, et l’Assurance Maladie ne verse donc pas d’indemnité, malgré l’inscription à France Travail.

En espérant que notre réponse vous sera utile, nous vous souhaitons une belle journée.
L’équipe LegalPlace.

bonjour,
Je suis inscrite à France Travail depuis le 1er décembre 2024 et indemnisée depuis le 19/4/2025 (carence entre temps). J’ai ouvert brièvement une activité d’auto-entreprise entre le 1er août et le 31 décembre 2024. Je suis en arrêt maladie depuis le 5 août 2025. Quelles indemnités vais-je toucher ? Celles de l’activité salariée ou activité d’auto-entreprise ? Merci

Bonjour,

En principe, si vous êtes indemnisée par France Travail au titre de votre activité salariée et que votre statut d’auto-entrepreneur est clos depuis le 31 décembre 2024, l’arrêt de travail débuté en août 2025 ouvre droit, sous conditions, à des indemnités journalières calculées sur votre dernier emploi salarié, conformément à l’article R. 313-3 du Code de la sécurité sociale.

L’activité d’auto-entrepreneur étant close, elle n’est pas prise en compte dans le calcul des indemnités maladie versées par l’Assurance maladie.

En espérant que notre réponse vous sera utile, nous vous souhaitons une belle journée.
L’équipe LegalPlace.

Bonjour je suis salarié d’une entreprise où je suis en arrêt maladie et j’ai aussi une activité d’auto-entrepreneur à CPM vient de me couper mes droits du fait que je viens de reprendre mon activité seulement d’auto-entrepreneur et que je suis toujours en arrêt pour mon salariat ils me disent que je n’ai pas le droit de reprendre d’activité du tout je ne comprends pas alors que l’on m’a dit le contraire lors de mon appel à la CPAM avec une autre personne pour pouvoir être sûr d’être en règle en faisant ça Pouvez-vous me donner des renseignements s’il vous… Lire la suite »

Bonjour,

Votre situation est complexe et nécessite l’avis d’un professionnel.
Nous vous invitons à prendre contact avec un avocat spécialisé, qui saura vous renseigner.

En vous souhaitant une belle journée,
L’équipe LegalPlace

Bonsoir,
Auto-entrepreneuse, en arrêt maladie depuis 14 mois, j’ai perçu des IJ jusqu’à la convocation avec Médecin Conseil d3 la Cpam, qui estime mon état stabilisé, il m’invite à reprendre mon travail… Or c’est à cause de ce travail que je suis en AM… Mon médecin traitant continue de m’arrêter et me préconise une reconversion.
Est-ce possible d’obtenir un certificat d’inaptitude? et si oui par qui? mon médecin traitant?
Merci d’avance

Bonjour,
En tant qu’auto-entrepreneuse, la notion d’inaptitude telle qu’elle s’applique aux salariés ne s’applique pas de la même manière. Le certificat d’inaptitude est délivré par la médecine du travail aux salariés pour constater leur impossibilité à reprendre leur poste. Dans votre situation, c’est votre médecin traitant qui reste l’interlocuteur principal pour évaluer votre état de santé et prescrire un arrêt ou orienter vers une reconversion professionnelle.
En espérant que notre réponse vous sera utile, nous vous souhaitons une belle journée.
L’équipe LegalPlace.

Bonjour je auto entrepreneur j’ai eu un accident de travail lors de mon activité professionnelle hors cadre de la micro entreprise, es que je dois arrêter mon activité d’auto entrepreneur aussi

Bonjour,

En tant qu’auto-entrepreneur, si vous avez eu un accident de travail dans une autre activité, vous n’êtes pas obligé de cesser votre activité d’auto-entrepreneur. Cependant, si l’accident limite vos capacités à exercer cette activité, vous pouvez demander un arrêt de travail spécifique pour votre micro-entreprise auprès de votre caisse d’assurance maladie (sous conditions).

Il est important de vérifier si votre contrat d’assurance professionnelle couvre les éventuelles conséquences de cet accident sur votre activité indépendante.

En espérant que notre réponse vous sera utile, nous vous souhaitons une belle journée. L’équipe LegalPlace.

Bonjour, Je suis auto-entrepreneuse depuis 2009 et j’ai fait un burn out en décembre 2023. Depuis j’ai tout arrêté, j’ai décidé de me reconvertir et je me suis inscrite chez France Travail (je n’ai droit à aucune allocation mais au moins je peux être un peu accompagnée dans ma réflexion). J’avoue que je n’ai pas imaginé que je pouvais avoir droit à une quelconque indemnités maladie … Savez-vous si j’y ai droit ?

Bonjour, En principe, pour pouvoir bénéficier des indemnités journalières en cas d’arrêt maladie en tant qu’auto-entrepreneur, vous devez remplir les conditions suivantes : justifier d’au moins 12 mois d’affiliation continus dans cette activité, être dans l’incapacité temporaire de continuer ou de reprendre une activité professionnelle pour cause de maladie, avoir un arrêt de travail prescrit par votre médecin traitant ayant constaté cette incapacité de continuer ou de reprendre une activité professionnelle, avoir arrêté votre activité. Pour plus de renseignements sur votre situation personnelle, nous vous invitons à contacter votre caisse primaire d’assurance maladie. En vous souhaitant une agréable journée. L’équipe… Lire la suite »

Rédigé par

Samuel Goldstein

Samuel est co-fondateur de LegalPlace et responsable du contenu éditorial. L'ambition est de rendre accessible le savoir-faire juridique au plus grand nombre grâce à un contenu simple et de qualité. Samuel est diplômé de Supelec et de HEC Paris